Los entes fundadores de la Fundación Escuela de Medicina Nuclear encomendaron su dirección a un Consejo de Administración conformado por dos representantes de cada uno de los organismos.

Consejo de Administración actual

Presidente: Ing. Enrique Noya (Comisión Nacional de Energía Atómica)

Vice Presidente: Dr. Ricardo Landete (Gobierno de Mza.)

Secretario: Ing. Mauricio Bisauta (Comisión Nacional de Energía Atómica)

Secretario Académico: Dr. Gustavo Kent (Universidad Nacional de Cuyo)

Vocal: Dr. Roberto Vallés (Universidad Nacional de Cuyo)

Vocal:Dr. Diego Guzzanti (Gobierno de Mza.)